Разработка дуплексной тест-системы ПЦР для дифференциальной диагностики сеториоза пшеницы

  • Кожабергенов Н.С., Тайлакова Э.Т., Исабек А.У., Бурашев Е.Д., Султанкулова К.Т., Рсалиев А.С. Научно-исследовательский институт проблем биологической безопасности, Казахстан, пгт. Гвардейский, Кордайский район, Жамбылская область

Аннотация

В настоящее время септориоз является одним из наиболее вредоносных и экономически значимых заболеваний пшеницы в мире, особенно в странах с умеренным климатом. Потери от болезни в эпифитотийные годы могут достигать 20-40 %. В Казахстане септориоз занимает одну из доминирующих положений среди грибных болезней зерновых культур. В связи с неблагоприятной обстановкой в стране по данному виду заболевания требуется быстрая диагностика фитопатогенов для своевременного реагирования и принятия необходимых мер. Для решения этих задач разработана дуплексная тест-система на основе метода полимеразной цепной реакции (ПЦР). При разработке ПЦР тест-системы для дифференциальной диагностики септориоза применены молекулярно-биологические методы, с помощью которых определены наиболее консервативные участки генов грибов Parastagonospora nodorum и Zymoseptoria tritici. По найденным участкам сконструированы видоспецифичные пары праймеров, пригодные для мультиплексной детекции целевых патогенов. Оптимизированы параметры постановки ПЦР. Разработанная тест-система проверена по параметрам специфичности и чувствительности с применением ДНК грибов Zymoseptoria tritici, Parastagonospora nodorum, Pyrenophora triticirepentis, Alternaria alternata, Alternaria infectoria, Fusarium, Ascomycota, Epicoccum. Результаты лабораторных испытаний показали, что тест-система работает специфично, и чувствительность составляет 5 пикограмм ДНК в одной реакции. Ключевые слова: Parastagonospora nodorum, Zymoseptoria tritici, ПЦР, праймеры, ДНК.
Как цитировать
СУЛТАНКУЛОВА К.Т., РСАЛИЕВ А.С., Кожабергенов Н.С., Тайлакова Э.Т., Исабек А.У., Бурашев Е.Д.,. Разработка дуплексной тест-системы ПЦР для дифференциальной диагностики сеториоза пшеницы. Вестник КазНУ. Серия экологическая, [S.l.], v. 63, n. 2, p. 63-70, june 2020. ISSN 2617-7358. Доступно на: <https://bulletin-ecology.kaznu.kz/index.php/1-eco/article/view/1036>. Дата доступа: 06 july 2022 doi: https://doi.org/10.26577/EJE.2020.v63.i2.07.
Раздел
ОЦЕНКА ДЕЙСТВИЯ ЗАГРЯЗНИТЕЛЕЙ ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ НА БИОТУ И ЗДОРОВЬЕ НАСЕЛЕНИЯ