Изучение разнообразия вирусов рыб в акватории Центрального Каспийского моря методом метагеномного секвенирования

  • M Alexyuk ТОО «Научно – производственный центр микробиологии и вирусологии», г. Алматы, Казахстан http://orcid.org/0000-0003-3479-4438
  • P Alexyuk ТОО «Научно – производственный центр микробиологии и вирусологии», г. Алматы, Казахстан http://orcid.org/0000-0003-3638-3341
  • A Bogoyavlenskiy ТОО «Научно – производственный центр микробиологии и вирусологии», г. Алматы, Казахстан http://orcid.org/0000-0001-9579-2298
  • K Akanova ТОО «Научно – производственный центр микробиологии и вирусологии», г. Алматы, Казахстан http://orcid.org/0000-0001-9825-1569
  • Y Moldakhanov ТОО «Научно – производственный центр микробиологии и вирусологии», г. Алматы, Казахстан http://orcid.org/0000-0002-6168-4376
  • A Manakbayeva ТОО «Научно – производственный центр микробиологии и вирусологии», г. Алматы, Казахстан http://orcid.org/0000-0001-5938-7172
  • A Toleuzhanova ТОО «Научно – производственный центр микробиологии и вирусологии», г. Алматы, Казахстан http://orcid.org/0000-0003-1477-8780
  • V Berezin ТОО «Научно – производственный центр микробиологии и вирусологии», г. Алматы, Казахстан http://orcid.org/0000-0003-2648-8975

Аннотация

Развитие индустрии аквакультуры подобно любому производственному циклу сопровождается опасностью возникновения инфекционных заболеваний за счет увеличения особей на единице площади. Проблема усугубляется тем, что в аквакультуре как правило используется вода водоема, примыкающего к производственным резервуарам. Это стало причиной того, что вирус, не обладающий эпидемическим потенциалом в экосистеме в силу достаточного редкого соприкосновения особей одного вида, приобретает выраженные патогенные свойства. При этом некоторые новые вирусные патогены невозможно культивировать и получить к ним специфические антитела, что не даёт возможности их идентифицировать при использования традиционных методов клеточных культур или иммуноанализа. Метагеномные исследования являются относительно новым многогранным инструментом, позволяющим изучать и идентифицировать единичные вирусные инфекции или коинфекции различных водных организмов, проводить эволюционно-филогенетический анализ вирусов, определять их геномное разнообразие и осуществлять эпидемиологический мониторинг вирусных инфекций.
В представленной статье показаны краткие результаты работ по определению разнообразия вирусов рыб в акватории Центрального Каспия, полученных в ходе метагеномных исследований при помощи NGS. Было показано наличие ряда РНК и ДНК содержащих вирусов, представляющих потенциальную опасность при развитии аквакультуры региона.
Ключевые слова: Каспийское море, метагеномика, виром, вирусы рыб, разнообразие.
Как цитировать
ALEXYUK, M et al. Изучение разнообразия вирусов рыб в акватории Центрального Каспийского моря методом метагеномного секвенирования. Вестник КазНУ. Серия экологическая, [S.l.], v. 75, n. 2, june 2023. ISSN 2617-7358. Доступно на: <https://bulletin-ecology.kaznu.kz/index.php/1-eco/article/view/1490>. Дата доступа: 24 sep. 2023 doi: https://doi.org/10.26577/EJE.2023.v75.i2.06.
Раздел
АКТУАЛЬНЫЕ ПРОБЛЕМЫ СОХРАНЕНИЯ БИОЛОГИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ